Simulación de altas prestaciones (GPU) para la reproducción del mosquito Aedes aegypti en el cementerio de Santo Tomé, Corrientes

El Dengue, Zika y Chikungunya, son las enfermedades reemergentes de mayor preocupación a nivel mundial. La carencia de tratamientos médicos obliga a los agentes de salud a abordar la contención de los focos infecciosos desde la identificación y eliminación de los criaderos del vector transmisor. Una herramienta tecnológica que ayude en la toma de decisiones representa la solución a los costos asociados al tiempo de recolección de muestras y el análisis de datos, además de la consiguiente reducción de los gastos económicos. En este trabajo se presenta un modelo basado en agentes en GPU para la evaluación de la reproducción del vector Aedes aegypti, orientado a la toma de decisiones. El modelo ha sido validado con datos de Santo Tomé, Corrientes, dando excelentes resultados. En el trabajo se muestran las ventajas de utilizar una arquitectura paralela (GPU) para reducir el tiempo de cómputo de las simulaciones y, se presentan los resultados de una predicción realizada y validada con datos del sistema real.XX Workshop Procesamiento Distribuido y Paralelo.Red de Universidades con Carreras en Informátic

Modelado del efecto de la variabilidad climática local sobre la transmisión de dengue en Medellín (Colombia) mediante análisis de series temporales

Introduction: Dengue fever is a major impact on public health vector-borne disease, and its transmission is influenced by entomological, sociocultural and economic factors. Additionally, climate variability plays an important role in the transmission dynamics. A large scientific consensus has indicated that the strong association between climatic variables and disease could be used to develop models to explain the incidence of the disease.Objective: To develop a model that provides a better understanding of dengue transmission dynamics in Medellin and predicts increases in the incidence of the disease.Materials and methods: The incidence of dengue fever was used as dependent variable, and weekly climatic factors (maximum, mean and minimum temperature, relative humidity and precipitation) as independent variables. Expert Modeler was used to develop a model to better explain the behaviorof the disease. Climatic variables with significant association to the dependent variable were selected through ARIMA models.Results: The model explains 34% of observed variability. Precipitation was the climatic variable showing statistically significant association with the incidence of dengue fever, but with a 20 weeks delay.Conclusions: In Medellin, the transmission of dengue fever was influenced by climate variability, especially precipitation. The strong association dengue fever/precipitation allowed the construction of a model to help understand dengue transmission dynamics. This information will be useful to develop appropriate and timely strategies for dengue control.doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i0.1444Introducción. El dengue es una enfermedad de transmisión vectorial de gran impacto en la salud pública. La transmisión del dengue es afectada por factores entomológicos, socioculturales y económicos. Además, la variabilidad climática juega un importante papel en la dinámica de transmisión. Un amplio consenso científico ha indicado que la fuerte asociación entre la enfermedad y las variables climáticas podría ser empleada para desarrollar modelos que expliquen la incidencia de la enfermedad.Objetivo. Desarrollar un modelo que permita comprender la dinámica de transmisión del dengue en Medellín y predecir incrementos en la incidencia de la enfermedad.Materiales y métodos. Se empleó la incidencia de dengue como variable dependiente y como variables independientes, los factores climáticos (temperatura máxima, media y mínima, humedad relativa y precipitación) registrados a escala semanal. Se utilizó el programa Expert Modeler para desarrollar un modelo que explique mejor el comportamiento de la enfermedad. Mediante modelos ARIMA, se seleccionaron las variables climáticas que tuvieron una relación significativa con la variable dependiente.Resultados. El 34 % de la variabilidad observada se explicó por el modelo. La precipitación fue la variable climática que mostró una asociación estadísticamente significativa con la incidencia del dengue, pero con un rezago de 20 semanas.Conclusiones. La transmisión del dengue en Medellín se vio afectada por la variabilidad climática, en particular, por la precipitación. La fuerte asociación entre el dengue y la precipitación permitió construir un modelo que ayuda a comprender la dinámica de transmisión, información que será de gran utilidad para el desarrollo de adecuadas y oportunas estrategias de control. doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i0.1444

Manejo integral de un brote de dengue en el corregimiento la Buitrera, Santiago de Cali, Colombia

Background: Dengue is a highly prevalent arbovirosis, with great epidemiological, social, and economic impact worldwide. In Cali, this disease presents asynchronous behavior. The Corregimiento La Buitrera, a rural area of Cali, regularly reports cases of dengue, however, during 2022 an unusual increase in cases led the Cali District Health Secretariat to carry out articulated actions to contain the outbreak. Objective: Describe the comprehensive management actions that allowed containing a dengue outbreak in the context of the COVID-19 pandemic. Methods: An active review of the notification of cases of dengue, severe dengue, and death due to dengue in SIVIGILA was carried out. The management was carried out in five institutions where users of the Corregimiento were served and integrated vector management activities were evaluated and monitored. Results: 16 cases of dengue were detected in the La Buitrera district. The percentage of dengue cases reported for 2022 (2.58%) exceeded those of epidemic years (2016 and 2020) in Santiago de Cali. 47.75% of the cases corresponded to DENV-2. 15.9% of the homes and 25% of the human concentrations inspected had at least one Aedes aegypti breeding site. The main difficulty in the IPS evaluation was adherence to the guidelines and management protocols for vector-borne diseases. Conclusion: The articulated and timely actions of the District Public Health Secretariat significantly influenced the containment of the outbreak, which can serve as a model for future epidemiological situations.Antecedentes: El dengue es una arbovirosis de alta prevalencia, con gran impacto epidemiológico, social y económico a nivel mundial. En Cali, esta enfermedad presenta un comportamiento asincrónico. El Corregimiento La Buitrera, área rural de Cali, notifica regularmente casos de dengue, sin embargo, durante 2022 un incremento inusual de casos que conllevó a la Secretaría Distrital de Salud de Cali a realizar acciones articuladas para contener el brote. Objetivo: Describir las acciones de manejo integral que permitieron contener un brote de dengue en el contexto de pandemia COVID-19. Métodos: Se realizó revisión activa de la notificación de casos de dengue, dengue grave y muerte por dengue en SIVIGILA. Se evaluó y acompañó la gestión realizada en cinco instituciones donde fueron atendidos usuarios del Corregimiento y se ejecutaron actividades de manejo integrado del vector. Resultados: Se detectaron 16 casos de dengue en el Corregimiento La Buitrera. El porcentaje de casos de dengue notificados para 2022 (2.58%) superó los porcentajes de años epidémicos (2016 y 2020) en Santiago de Cali. 47.75% de los casos correspondieron a DENV-2. 15.9% de las viviendas y 25% de las concentraciones humanas inspeccionadas tuvieron al menos un criadero de Aedes. aegypti. La principal dificultad en las IPS evaluadas fue la adherencia a las guías y protocolos de manejo en enfermedades trasmitidas por vectores. Conclusión: Las acciones articuladas y oportunas de la Secretaría de Salud Pública Distrital influyeron notablemente en la contención del brote, lo cual puede servir de modelo frente a futuras situaciones epidemiológicas

Desarrollo de Modelos e Indicadores Remotos de Riesgo Epidemiológico de Dengue en Argentina.

Tesis (Grado Doctor en Ciencias Biológicas)--Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Lugar de Trabajo: Instituto de Altos Estudios Espaciales "Mario Gulich". Comisión Nacional de Actividades Espaciales. Universidad Nacional de Córdoba. 2013-164 h. con Anexos + CD. tabls.; grafs. Contiene Referencia Bibliográfica.+ Copias de Publicaciones Derivada de la Tesis. Abstract en español e inglés.Tomando en cuenta que en Argentina la ocurrencia de los brotes de Dengue presenta intensidad creciente desde su re-emergencia en 1998, con circulación simultánea de distintos serotipos, y que no existe hasta el momento vacuna o tratamiento específico para humanos, una de las soluciones más plausibles, para prevenir la enfermedad, es la vigilancia epidemiológica concomitante a la prevención/control estratégico del vector. En ese contexto, el trabajo aquí desarrollado es fruto del trabajo interdisciplinario e interinstitucional enmarcado dentro de las actividades que desempeña el Instituto Gulich (CONAE), como nodo científico-técnico de integración entre quienes queremos desarrollar y/o adaptar nuevas herramientas geoespaciales con el fin de optimizar las tareas de vigilancia y control de enfermedades humanas.* En el Capítulo I se desarrolla una introducción general a la problemática del Dengue, a escalas globales y regionales, a la distribución, ecología y comportamiento del vector Aedes aegypti y a conceptos generales de la disciplina Epidemiología Panorámica. * En el Capítulo II se explora el potencial de información derivada de sensores remotos y técnicas de clasificación digital de imágenes, para el desarrollo de un modelo Espacio-Temporal de dispersión de insectos voladores, en ambientes no homogéneos reales caracterizados por la textura del paisaje. * En el Capítulo III se generan modelos empíricos de favorabilidad ambiental desarrollo de Aedes aegypti a dos escalas distintas. A nivel de la distribución espacial, se desarrollaron mapas predictivos, de la densidad focal de Aedes aegypti, para la ciudad de Puerto Iguazú (Misiones), basados en información ambiental derivada de imágenes de alta resolución espacial SPOT 5 HRG1 y de resolución espacial media de temperatura de superficie derivada de información del satélite Landsat 5. A escala temporal, se generó un modelo predictivo de índices aédicos quincenales, para la ciudad de Tartagal (Salta), basado en información macro-ambiental proveniente de sensores Landsat TM y ETM, e información vectorial de monitoreo y control. * En el Capítulo IV, se estiman patrones epidemiológicos Espacio-temporales y parámetros poblacionales de Aedes aegypti a campo, a partir de la geolocalización de casos de Dengue, durante un brote ocurrido en la ciudad de Tartagal en 2004. A su vez, se estima la efectividad de las medidas del control vectorial durante el brote, a través de una rutina de programación que adapta conceptos del test de Knox para análisis espacio-temporales. * En el Capítulo V se construyen mapas de vulnerabilidad ambiental a la transmisión de Dengue y Encefalitis de San Luis y se evalúa la predictibilidad de variables macroambientales derivadas de imágenes satelitales. * Por último, en la Conclusión general de la tesis se comparan las bondades de los resultados obtenidos con otros trabajos y, a su vez, se proponen herramientas inherentes a la construcción/actualización de Sistemas de Información Geográfica ad hoc para la vigilancia epidemiológica, en pos del aumento de precisión y simplificación tanto de las tareas de notificación, como de las tareas operativas de prevención y control

Study of the incidence of dengue in the department of Quindío during the years from 1999 to 2010

El dengue, enfermedad reemergente y emergente, es una de las prioridades de salud pública en Colombia. El principal vector en las áreas endémicas es el Stegomyia aegypti, más conocido como Aedes aegypti, que se encuentra distribuido en todo el territorio nacional. La ubicación geográfica, el clima, la urbanización no planificada, la calidad de vida, la vulnerabilidad de la población expuesta, la expansión e intensificación de la infestación del vector y la circulación simultánea de diferentes serotipos son factores determinantes de la enfermedad. El análisis de los efectos del clima en la incidencia del dengue es necesario para establecer lineamientos requeridos por los planes de salud pública y las estrategias de adaptación. Teniendo en cuenta la influencia de las condiciones locales en el clima, se plantean el caso de estudio en el Centro-occidente Colombiano donde serán analizados los departamentos de Caldas, Quindío y Risaralda. Estos casos de estudio, seleccionados por conveniencia dada la localización geográfica del investigador, tienen características geográficas y socioeconómicas diversas que permitirían evaluar no sólo la influencia de las condiciones climáticas, sino también algunas variables socioeconómicas, en la incidencia de la enfermedad. El estudio comprende el análisis de las estadísticas epidemiológicas en los departamentos objeto de estudio; la evaluación de la influencia de la variabilidad climática en la incidencia del dengue en estas zonas; la estimación de los posibles cambios futuros en el clima que pueden tener influencia sobre la transmisión y el planteamiento de recomendaciones para los planes de salud pública para las regiones analizadas. En la caracterización de las tasas de incidencia del dengue se utilizará la información epidemiológica disponible en el Ministerio de Salud y Protección Social y el Instituto Nacional de Salud; serán consideradas las estadísticas y proyecciones del Departamento Administrativo Nacional de Estadísticas (DANE) y otros indicadores socioeconómicos que permitan caracterizar las regiones objeto de estudio. El análisis de las condiciones climáticas será realizado a partir de las estaciones meteorológicas disponibles en la zona e información de sensores remotos. Para el análisis de variabilidad climática será considerado el índice Oceánico el Niño propuesto por la NOAA- National Oceanic and Atmospheric Administration-. Con respecto a las proyecciones de cambio climático serán estimadas considerando los escenarios planteados por el Panel Intergubernamental de Cambio Climático, IPCC. Para el análisis de la información serán empleados los sistemas de información geográfica – SIG-; específicamente el software ArcGis. En el análisis estadístico y de correlación serán utilizados el software Microsoft Excel y SSPS IBM Statistics. Se espera que los resultados de la investigación permitan una mejor comprensión de las relaciones de los factores climáticos en la incidencia del dengue de tal manera que se brinden lineamientos para los planes de salud pública y de adaptación frente al cambio climático.1. RESUMEN 3 2. PLAN DE RECOLECCIÓN DE INFORMACIÓN: 5 3. PLAN DE TABULACIÓN: 5 4. PLAN DE ANÁLISIS: 6 5. DESCRIPCION DEL PROYECTO 6 5.1 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA DE INVESTIGACION 6 5.2 FORMULACIÓN DEL PROBLEMA DE INVESTIGACIÓN 13 5.3 JUSTIFICACIÓN 13 5.4 MARCO TEÓRICO 15 5.4.1 DENGUE 15 5.4.2 Macrodeterminantes de la transmisión del dengue 18 5.4.3 Microdeterminantes de la transmisión del dengue 19 5.5 CAMBIO CLIMÁTICO 19 5.6 VARIABILIDAD CLIMÁTICA EN COLOMBIA 20 5.7 CAMBIO CLIMÁTICO, VARIABILIDAD CLIMÁTICA Y DENGUE 22 6. OBJETIVOS 25 6.1 OBJETIVO GENERAL 25 6.2 OBJETIVOS ESPECIFICOS 25 7. METODOLOGÍA 25 7.1 METODOLOGÍA OBJETIVO 1 25 7.2. METODOLOGÍA OBJETIVO 2 26 8. CONTROL A POSIBLES SESGOS 29 9. CONSIDERACIONES ÈTICAS. 29 10. CRONOGRAMA DE ACTIVIDADES 30 11. PRESUPUESTO 30 BIBLIOGRAFÍA 32EspecializaciónDengue, a reemerging and emerging disease, is one of the public health priorities in Colombia. The main vector in endemic areas is Stegomyia aegypti, better known as Aedes aegypti, which is distributed throughout the national territory. Geographical location, climate, unplanned urbanization, quality of life, vulnerability of the exposed population, expansion and intensification of vector infestation, and the simultaneous circulation of different serotypes are determining factors of the disease. The analysis of the effects of climate on the incidence of dengue is necessary to establish the guidelines required by public health plans and adaptation strategies. Taking into account the influence of local conditions on the climate, the case study is proposed in the Central-western Colombia where the departments of Caldas, Quindío and Risaralda will be analyzed. These case studies, selected for convenience given the researcher's geographic location, have diverse geographic and socioeconomic characteristics that would allow evaluating not only the influence of climatic conditions, but also some socioeconomic variables, on the incidence of the disease. The study includes the analysis of epidemiological statistics in the departments under study; the evaluation of the influence of climate variability on the incidence of dengue in these areas; the estimation of possible future changes in the climate that may have an influence on transmission and the formulation of recommendations for public health plans for the analyzed regions. In the characterization of the incidence rates of dengue, the epidemiological information available in the Ministry of Health and Social Protection and the National Institute of Health will be used; The statistics and projections of the National Administrative Department of Statistics (DANE) and other socioeconomic indicators that allow characterizing the regions under study will be considered. The analysis of the climatic conditions will be carried out from the meteorological stations available in the area and information from remote sensors. For the analysis of climate variability, the El Niño Oceanic Index proposed by the NOAA- National Oceanic and Atmospheric Administration- will be considered. With regard to climate change projections, they will be estimated considering the scenarios proposed by the Intergovernmental Panel on Climate Change, IPCC. For the analysis of the information, the geographic information systems - GIS- will be used; specifically ArcGis software. In the statistical and correlation analysis, Microsoft Excel and SSPS IBM Statistics software will be used. The results of the research are expected to allow a better understanding of the relationships of climatic factors in the incidence of dengue in such a way as to provide guidelines for public health plans and adaptation to climate change

Diseño metodológico para el análisis espacial del riesgo asociado al virus del dengue en el municipio de Pitalito, aplicando los sistemas de información geográfica SIG.

El presente proyecto propone elaborar una ruta metodológica que sirva de guía para realizar el análisis de la presencia, distribución y zonificación espacial del virus del dengue, inicialmente en la zona urbana del Municipio de Pitalito, el modelo describe de forma práctica todas las fases para elaborar la ruta del análisis; desde la recolección de la información, interpretación y análisis de los datos, tabulación de datos, principios básicos de estadística espacial, específicamente la exploración de datos espaciales, uso software de sistema de información geográfica con el propósito de generar mapas donde se puedan identificar las zonas geográficas con mayor riesgo por el vector, lo anterior asociando las variables ambientales que influyen en la producción del virus con el fin de que sea una herramienta de toma de decisiones eficiente para las actividades de prevención del dengue.This project proposes to elaborate a methodological design that serves as a guide to carry out the analysis of the presence, distribution and spatial zoning of the dengue virus, initially in the urban area of the Municipality of Pitalito, the model describes in a practical way all the phases to elaborate the path of analysis; from the collection of information, interpretation and analysis of data, tabulation of data, basic principles of spatial statistics, specifically the exploration of spatial data, use of geographic information system software with the purpose of generating maps where areas can be identified geographical areas with higher risk due to the vector, the above associating the environmental variables that influence the production of the virus in order to be an efficient decision-making tool for dengue prevention activities

Factores relacionados en la dinámica del dengue en Guayaquil, basado en tendencias históricas

Establece la tendencia histórica de los factores en la dinámica del dengue en la ciudad de Guayaquil, durante el período 2008 - 2013. Utilizando un estudio observacional, de tipo descriptivo ecológico. En sus resultados, coincide que en la época de invierno se encuentra el mayor número de casos, pero con presencia durante todo el año; y al paso de los años 2010 y 2012 fueron de mayor incidencia, con una variabilidad en su comportamiento. Las variables ambientales mostraron hallazgos, en el que a más temperatura, con humedad por encima del 70% y escasos vientos, estos provocan condiciones para que pueda existir un incremento en la transmisión de la enfermedad. Además, los picos epidémicos de dengue presentados en los dos primeros períodos de cada año se relacionan en los mismos períodos con los índices de Breteau elevados considerados de alto riesgo, pudiendo influir en la transmisión de la enfermedad. Se comprueba la presencia de los 4 serotipos de virus circulante de dengue en Guayaquil, considerándose la existencia de circulación simultánea de DEN1, DEN2, y DEN4 durante los últimos 3 años. Por la historicidad de lo acontecido anteriormente en Guayaquil sobre la existencia del virus y personas susceptibles con infecciones previas, se ha creado una situación que pone en riesgo de dengue grave en un futuro próximo.Tesi

Susceptibility to distribution of the Chikungunya virus under climate change scenarios, Tolima department

Debido a los acelerados cambios que se han presentado a causa del cambio climático, Colombia es uno de los países más afectados por estar ubicado en el trópico, en donde se han observado problemas en salud pública como la aparición de enfermedades tropicales que se han ido expandido por gran parte del país. Por su variedad climática encontramos que departamentos como el Tolima han presentado un aumento en el número de casos reportados por enfermedades tropicales en la que está presente el virus del Chikunguña, como en los municipios de Melgar, Flandes, Ibagué y El Espinal. Es por ello, que se propone una metodología que permita estudiar y determinar la relación del clima con la extensión o distribución del virus por la transmisión del mosquito vector de la especie Aedes, (A. aegypti y A. albopice) en posibles condiciones climáticas a futuro.Due to the rapid changes that have occurred due to climate change, Colombia is one of the countries most affected by being located in the tropics, where problems have been observed in public health such as the emergence of tropical diseases that have expanded for much of the country. Due to its climatic variety, we find that departments such as Tolima have presented an increase in the number of cases reported for tropical diseases in which the Chikungunya virus is present, such as in the municipalities of Melgar, Flandes, Ibagué and El Espinal. For this reason, a methodology is proposed that allows studying and determining the relationship of the climate with the spread or distribution of the virus by the transmission of the Aedes vector mosquito (A. aegypti and A. albopice) in possible climatic conditions. future